9月12日下午14:00，航海学院江文书记、李翼副院长（主持）、朱宝杉副书记组织召开疫情防控工作线上会议，会议传达了当日上午学校疫情防控专题会议精神，同时结合航海学院实际，逐项布置航海学院疫情防控工作。
会议指出，当前国内外疫情防控形势依然严峻复杂，校园疫情防控风险高、难度大，全体师生应克服麻痹思想、松懈情绪，逐项落实落细疫情防控工作；每位教师要结合疫情形势变化和学校教育教学安排，提前做好线上教学各项准备工作，保证线上教学随时启动、线上线下随时切换，确保停课不停教、停课不停学；辅导员、班主任要强化心理疏导和健康教育，及时协调解决暂未返校学生的学习、工作、生活问题，加强人文关怀，营造校园疫情防控良好氛围。
会议强调，截至9月11日20时，仙游县已有2地划定为高风险地区、5地为中风险地区，目前尚在莆田市内的师生暂缓返校；自8月26日以来（含8月26日）本人或共同居住人员中有莆田市旅居史的师生暂缓返校并实施14天居家健康监测（从离开莆田市次日起算），已返校的学生要及时报告辅导员、班主任，按照要求进行隔离观察，实施每日健康监测。
会后，航海学院领导带队检查了防疫物资储备情况，走访了学生宿舍、教室、实验实训室等重点场所。