在示范性院校建设的推动下，体育学科建设得到规范和发展。通过课程改革，目前设有公共体育和航海体育两大模块。公共体育设有基础体育和专项体育，依据《全国普通高等学校体育教学指导纲要》及《关于认真贯彻落实中共中央国务院关于加强青少年体质的意见精神切实加强学校体育工作的实施意见》闽教体[2007]20号文件精神，体育课程改革建设指导思想明确，坚决执行144学时规定，三年级开设二年体育课，每周二学时，并选用“十一五”规划教材、省编教材及自编教材。